欢迎计算软件、分子模拟等领域的国内外访问学者、博士后和研究生  

（最新博士后资助项目：优秀者可申请科学院“率先行动”计划实施的联合资助优秀博士后项目（请参考相关信息） ）

• 计算方法与软件
• 多尺度生物/化学体系的模拟：目前主要涉及分子静电、反应扩散、电弹性耦合、复杂分子溶液体系的物理化学性质及其连续模型模拟；分子表面网格产生与可视化方面的建模、算法研究与实现、及应用研究，如离子通道、纳米管及胞内离子分子的输运；分子模拟方法与应用
• 可视化，图像、网格生成与几何分析
• 在线科学计算云
• 网页http://lsec.cc.a及www.xyzgate.org （建设中）。

已开发或合作开发的应用程序：（1）AFMPB – adaptive fast multipole Poisson-Boltzmann 静电计算程序，发展了“node-patch” 边界元方法并结合了高效的自适应快速多极矩方法，最近也实现了多核多线程并行，基本实现了可在台式机上处理PDB (蛋白质数据银行)中最大的生物分子的可能性。串行源程序已公布，并行程序不久也将公布。（2）分子表面网格产生程序 TMSmesh。高效高质量的网格产生仍是一个十分困难的问题。我们最近发展了强有力的表面三角网格生成方法和工具：TMSmesh，可以处理PDB库中的任意大小分子，执行软件已公布，（3）PNP solver及离子通道/纳米管模拟器ichannel, 在PHG有限元程序包的基础上开发的求解Poisson-Nernst-Planck方程及其若干扩展形式的程序，包括非线性PB方程，扩散方程，及其完全耦合的非线性偏微分方程组。进行实时实形（真实分子几何）模拟电扩散过程和计算复杂分子-溶液相互作用体系的物理化学性质。（4）开发了一套用于分子连续模型模拟的可视化和分析软件 VCMM（Visual tool for continuum modeling），拓展了目前分子可视化软件的处理范围，包括结构化网格、非结构化网格以及基于它们的(如有限元、边界元)计算结果的可视化和分析。除用于分子模拟外，VCMM也可用于计算量子化学、材料科学等广泛领域。 另外，实验室也具备若干常用的分子动力学模拟计算软件包，如AMBER, APBS, GROMACS, CHARMM, UHBD, NAMD, GROMOS, GAUSSIAN等。　

本课题组也欢迎理论或计算数学/物理、分子模拟、软件等专业的访问学者和博士后，国内高校博士生访学项目等。

本研究组同时依属中国科学院科学与工程计算国家重点实验室和国家数学与交叉科学中心，本单位具备较强的计算数学研究队伍，一流的科研条件和丰富的计算机软硬件资源（一个2200节点的计算机群，一个SGI O3800超级服务器和若干工作站) 。除此之外，若有必要，本实验室也会尽量为组内工作人员配备所需要的高端计算机设备。

  国内外访问学者/学生、博士后、研究生待遇可参考本所或国家数学与交叉中心的有关规定。   访问学者也可申请本所的国家重点实验室开放课题，请参考http://lsec.cc.ac.cn/chinese/lsec/indexcn.html

其它博士后资助项目：可关注申请最新国家或科学院有关优秀博士后项目（请参考相关信息）

• 欢迎参加数学院每年举行的研究生免推选拔，或者统考招收的研究生
• 博士硕士统考考试科目：

（见 院网页：http://www2.amss.ac.cn/yjsb/mysite3/new_page_2.htm）

硕士：学科专业：计算数学；研究方向：生物计算与模拟。考试科目：①政治 ②英语 ③数学分析 ④高等代数

（有关试题大纲、要求等信息见数学与系统科学研究院网页）

博士：学科专业：计算数学；研究方向：生物计算与模拟。考试科目：①英语 ②分析与代数 ③数值方法基础

  （见数学与系统科学研究院的招生网页：http://www.amss.cas.cn/yjsjy/zs/bszs/，参考书见 http://www.amss.cas.cn/yjsjy/zs/bszs/200907/P020100915503255859600.pdf，

招生目录见 http://www.amss.cas.cn/yjsjy/zs/bszs/201006/P020100819618530392119.pdf）